Yoon Eun hye memulai debutnya sebagai personil Baby V.O.X saat berumur 15 tahun, menggantikan Lee Gai pada tahun 1999. Yoon menjadi sub-vokal dalam grup tersebut, terkenal karena keimutan wajahnya dan tingkah lakunya yang seperti anak-anak. Karena menjadi personil yang paling muda, ia tidak terlalu mendapat perhatian dari publik dan lebih sering dibayang-bayangi oleh keempat personil lainnya.